Le fichier PDF se fait très rapidement, presque plus que par une imprimante PDF, car il n'y a pas besoin de valider plusieurs fois, et les options ne sont pas nombreuses : on va vite. Fonctionne également sans scanner relié à la machine, et admet en entrée gif, jpg, bmp, ico, wmf, emf, tiff et ico.

La couleur de l'arrière plan est paramétrable, et il est possible de redimensionner les images et d'ajouter du texte directement depuis Scan2pdf. Un "mode pro" permet d'avoir toutes les fenêtres d'interface actives en même temps.